Durante la Guerra Civil, el Palacio de El Pardo se convirtió en el Cuartel General de una División del Ejército Republicano, que se desplegó por todo el monte circundante, fortificándolo con construcciones militares (trincheras, búnkeres, refugios…). Todo ello con el fin de evitar ataques de los sublevados (nacionales), impedir que cortaran las carreteras a los frentes de la sierra e intentasen tomar la capital desde el norte.
En el edificio del antiguo orfanato (hoy Cuartel del Rey de la Guardia Real) se alojaron parte de los miembros de la XII Brigada Internacional, que combatieron en la zona de la Ciudad Universitaria y en la batalla de la carretera de La Coruña.
Acabada la guerra, con el triunfo de los sublevados, el Palacio pasó a ser la residencia oficial del Jefe del Estado Francisco Franco, que lo ocupó desde 1940 hasta su muerte en 1975. Tras la Guerra Civil, tuvo lugar la mayor transformación del Real Sitio.
Momentos históricos y vecinos ilustres